Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO1P25800 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO1P25800 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LMO1P25800 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LMO1P25800 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LMO1P25800 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LMO1P25800 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LMO1P25800 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LMO1P25800 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LMO1P25800 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LMO1P25800 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LMO1P25800 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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