Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTSSP25774 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTSSP25774 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTSSP25774 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTSSP25774 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms