Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL1P22362 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL1P22362 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms