Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC1P15941 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MUC1P15941 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MUC1P15941 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms