Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOA1P02647 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA1P02647 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms