Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNKO75909 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNKO75909 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCNKO75909 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCNKO75909 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms