Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP9O75884 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms