Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F6O75461 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F6O75461 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F6O75461 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms