Protein–RNA interactions for Protein: O00585

CCL21, C-C motif chemokine 21, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21O00585 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL21O00585 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL21O00585 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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