Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EBAG9O00559 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms