Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC182A6NF36 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms