Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF330Q9Y3S2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms