Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP18Q9UMW8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP18Q9UMW8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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