Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBE1Q9UJT0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms