Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP25Q9UHP3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms