Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT172Q9UG01 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms