Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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