Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCHIP1Q9P0W5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms