Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms