Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHARPINQ9H0F6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms