Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms