Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms