Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD7

FAM173A, Protein FAM173A, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM173AQ9BQD7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM173AQ9BQD7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM173AQ9BQD7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms