Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms