Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
JSRP1Q96MG2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms