Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms