Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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COPS9Q8WXC6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COPS9Q8WXC6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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COPS9Q8WXC6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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COPS9Q8WXC6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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COPS9Q8WXC6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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COPS9Q8WXC6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COPS9Q8WXC6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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