Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA6DQ8NFY4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms