Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRC18Q8N456 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRC18Q8N456 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms