Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3X1

FNBP4, Formin-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNBP4Q8N3X1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNBP4Q8N3X1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms