Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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