Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBRM1Q86U86 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PBRM1Q86U86 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms