Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms