Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HACD2Q6Y1H2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HACD2Q6Y1H2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms