Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPTE2Q6XPS3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms