Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC171Q6TFL3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms