Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPP4R4Q6NUP7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms