Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRNP1Q6NT89 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms