Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RTL6Q6ICC9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RTL6Q6ICC9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RTL6Q6ICC9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RTL6Q6ICC9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RTL6Q6ICC9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RTL6Q6ICC9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RTL6Q6ICC9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RTL6Q6ICC9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RTL6Q6ICC9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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