Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q5VSD8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q5VSD8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q5VSD8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q5VSD8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q5VSD8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q5VSD8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q5VSD8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q5VSD8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q5VSD8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q5VSD8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q5VSD8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms