Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC27A3Q5K4L6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC27A3Q5K4L6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms