Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ALFQ53S48 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms