Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms