Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms