Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms