Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms