Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TWISTNBQ3B726 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWISTNBQ3B726 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms