Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP7Q16576 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms