Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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