Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCM1Q15154 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms